Este versus pinta a ser muy interesante, pues en el área de conocimientos todos los ninjas poseen habilidades muy versátiles con las cuales pueden formular buenas estrategias.
Para los Sannin:
Por un lado tenemos a unos de los trios mas emblemáticos y legendarios de toda la historia de Naruto, los 3 poseen masivas reservas de chakra, una por el Byakugou y los otros 2 por el Senjutsu, pueden hacer tremendas combinaciones con sus Invocaciones, tanto Jiraiya como Orochimaru poseen multiples tecnicas elementales y que decir de Tsunade, la cual además de brindar apoyo medico al mismo tiempo puede luchar mediante feats físicos. Personalmente son un team muy bueno.
Por desgracia Tsunade seria la que posee mayores "desventajas" ante los Akatsuki, pues fácilmente puede ser aturdida por el Genjutsu de Tayuyá de Kabuto y no creo que su fuerza física se equipare con la de Kisame en su Forma Tiburón, eso si, le doy un plus por sus habilidades de auto - regeneración.
Para los de Akatsuki:
La cooperatividad no es algo que se les da muy bien (considerando que Kakuzu mataba a todos sus ex - compañeros antes de Hidan y Kisame mantiene tendencias sadicas, literalmente Kabuto es el mas "cuerdo" de los 3 XD), sin embargo, no hay que menospreciarlos, Kakuzu posee amplia experiencia en combate (sobreviviendo ante Hashirama y venciendo a 2 Bijuus), y el uso del Jiongu le da una alta resistencia combinada con sus ataques elementales.
Respecto a Kisame, tiene menor variedad de elementos, pero el uso del Agua es jodidamente bueno, por no decir que rivaliza con Tobirama el 2° Hokage, sus invocaciones de Tiburones son muy poderosas y que decir de su dominio con Samehada asi como las masivas reservas de Chakra. Y por ultimo tenemos a Kabuto, quien no solo es alguien muy inteligente, sino muy calculador, formulando estrategias que retrasaba el progreso de la Alianza Shinobi, deduciendo la identidad de Obito, e ingeniándoselas para enfrentar a un Edo Itachi (el cual hubiera perdido si Sasuke no lo hubiera seguido), por no decir que de lejos es el que posee el mejor arsenal de habilidades e incluso un vasto conocimiento en el Ninjutsu Medico, aunque su mayor debilidad serian los feats físicos.
Un detalle muy importante que afectaría el resultado seria también el terreno donde pelean, puesto que si el combate seria en una costa o en la Aldea de la Lluvia, Kisame tendría una devastadora ventaja, o si el combate es en unas cavernas Kabuto y Orochimaru mostrarían sus mejores feats. Aun así considero que ganarían los Sannin, pero la dificultad seria extremadamente difícil.