gai no tiene el chakra para hacer eso, su chakra es grande, sí, pero es para potenciar su taijutsu al máximo, a menos que use la 8va puerta, pero con eso se muere.
y naruto aún sabiendo eso debió recurrir a los sapos para que lo apoyasen para poder llevarse a la que invoca y matarla.
en ese momento gai estaba atrapado, luego lo hace y queda para la historia, aparte de que el mismo obito dice que esos caminos son más débiles que los de nagato porque no tiene los dos ojos, necesitaría de mucho chakra para hacerlo.
gai es muy fuerte con las 7 puertas, pero no lo es para un pain con los 6 caminos a la vez independiente de que supiera todas las técnicas, necesitaría de algo que le de más resistencia, porque cada segundo que pasa con las 7 puertas, es un drenaje tremendo de chakra.
